Muzeum powstało w 1919 roku, początkowo jego siedzibą był pałac Staszica. W 1930 przeniosło się do gmachu zbudowanego wg projektu Mariana Lalewicza na działce otrzymanej od Ministerstwa Rolnictwa i Dóbr Państwowych. W pawilonie wschodnim mieściły się mieszkania personelu, w zachodnim pracownie naukowe, zbiory zgromadzono na przeszklonym dziedzińcu. W czasie okupacji niemieckiej muzeum nie działało. Podobno to jedyne w Polsce muzeum geologiczne, które w pełny sposób eksponuje zbiory związane z budową geologiczną naszego kraju. Lokalizacja: Mokotów